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标题: 蛋白质组学样品制备利器:新型重组Lys-C蛋白酶
详细内容:      近年来,Lys-C 蛋白酶越来越多地被用作胰蛋白酶的替代品或是补充。Lys-C 日益受到青睐主要归因于它能够在蛋白质变性条件下进行蛋白水解消化,这一特性可以极大地扩展可观察到的蛋白质组。

     Lys-C 在多种细菌宿主中存在,其中 Lysobacter enzymogenes 是商业可用 Lys-C 最常用的来源。Promega现已开发出了一种来自铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) 的重组形式的 Lys-C(rLys-C)。在这项研究中,我们将铜绿假单胞菌和 Lysobacter 的 Lys-C 的性能进行了比较,并证明了铜绿假单胞菌 Lys-C 对于蛋白质组学分析的优势。

     来自铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)的Lys-C蛋白酶:

● 高度蛋白水解活性的 Lys-C 蛋白酶是铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) 致病性的一个关键因素。

● 这种蛋白酶以 48 kDa 的非活性前体形式分泌,随后成熟为更小的活性酶。

● 研究表明,铜绿假单胞菌的 Lys-C 不仅表现出高蛋白水解活性,而且还具有非凡的切割特异性。

● 与其他 Lys-C 蛋白酶类似,铜绿假单胞菌的 Lys-C 能够承受强烈的蛋白质变性条件。Lys-C 蛋白酶的这一特性被广泛利用来消化那些对抗蛋白酶的蛋白质。

● 该蛋白酶与 Lysobacter Lys-C 具有极少的序列同源性。可能存在的情况是,铜绿假单胞菌和 Lysobacter 的 Lys-C 蛋白酶采用不同的机制来在赖氨酸残基的羧基端进行切割。

     重组的铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) Lys-C 蛋白酶:

● 在大肠杆菌 (E. coli) 中表达,以避免与病原体直接接触的需要,并提高蛋白酶的产量。

● 带有 HQ 标签,以简化纯化过程。

● 重组 Lys-C 蛋白酶经历自然成熟过程,以确保蛋白质正确折叠。成熟后的蛋白酶分子量为 27.7 kDa。

● 通过高效液相色谱 (HPLC) 检测,纯度超过 95%。

     铜绿假单胞菌重组 Lys-C (rLys-C) 显示出高度的切割特异性:

● 使用重组 Lys-C 对 Melittin 肽进行消化时,即使在长时间孵育后,也只在赖氨酸残基的羧基侧产生了特定的切割。

● 同样,在使用重组 Lys-C 消化的酵母蛋白抽提物中鉴定出的几乎所有肽段都具有 C-末端的赖氨酸。

     铜绿假单胞菌重组 Lys-C 能够耐受强烈的蛋白质变性条件(8M 尿素),有效地消化抗蛋白酶的肌红蛋白。

 

 

 
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